MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome I

Total Repeats: 63187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006840	AT	4	8	12	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006840	TTA	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006840	TAT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006840	TCG	2	6	62	67	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006840	GTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006840	TCTT	2	8	133	140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006840	AGTT	2	8	173	180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006840	G	6	6	189	194	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006840	ATAACT	2	12	219	230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006840	TAG	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006840	ATC	2	6	270	275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006840	TAA	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006840	ACA	2	6	300	305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006840	TTA	2	6	310	315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710608
15	NC_006840	TGT	2	6	323	328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710608
16	NC_006840	CTG	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710608
17	NC_006840	TTC	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710608
18	NC_006840	ATCT	2	8	376	383	25 %	50 %	0 %	25 %	59710608
19	NC_006840	CTG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710608
20	NC_006840	CAA	2	6	483	488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710608
21	NC_006840	TGT	2	6	552	557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710608
22	NC_006840	TATCAA	2	12	606	617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59710608
23	NC_006840	ATC	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710608
24	NC_006840	TCT	2	6	665	670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710608
25	NC_006840	CAC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710608
26	NC_006840	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710608
27	NC_006840	T	6	6	739	744	0 %	100 %	0 %	0 %	59710608
28	NC_006840	A	6	6	769	774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006840	ATT	2	6	792	797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006840	TTA	2	6	802	807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006840	TTTA	2	8	816	823	25 %	75 %	0 %	0 %	59710609
32	NC_006840	ATC	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710609
33	NC_006840	TGT	3	9	896	904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710609
34	NC_006840	TTC	2	6	916	921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
35	NC_006840	TTG	2	6	955	960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710609
36	NC_006840	GCT	2	6	983	988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710609
37	NC_006840	CGA	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710609
38	NC_006840	CTT	2	6	1032	1037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
39	NC_006840	T	6	6	1202	1207	0 %	100 %	0 %	0 %	59710609
40	NC_006840	AATT	2	8	1234	1241	50 %	50 %	0 %	0 %	59710609
41	NC_006840	TGT	3	9	1258	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710609
42	NC_006840	ATAA	2	8	1277	1284	75 %	25 %	0 %	0 %	59710609
43	NC_006840	CAATAC	2	12	1323	1334	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59710609
44	NC_006840	TCA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710609
45	NC_006840	AAT	2	6	1375	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710609
46	NC_006840	CT	3	6	1411	1416	0 %	50 %	0 %	50 %	59710609
47	NC_006840	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710609
48	NC_006840	GAC	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710609
49	NC_006840	AAC	2	6	1522	1527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710609
50	NC_006840	ATG	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710609
51	NC_006840	CTT	2	6	1563	1568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
52	NC_006840	ATG	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710609
53	NC_006840	CAC	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710609
54	NC_006840	TGC	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710609
55	NC_006840	TAGA	2	8	1684	1691	50 %	25 %	25 %	0 %	59710609
56	NC_006840	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710609
57	NC_006840	GAC	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710609
58	NC_006840	ACC	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710609
59	NC_006840	AATG	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	59710609
60	NC_006840	CTTTTG	2	12	2091	2102	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	59710609
61	NC_006840	ATG	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710609
62	NC_006840	CGC	2	6	2127	2132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59710609
63	NC_006840	CAA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710609
64	NC_006840	TGTA	2	8	2170	2177	25 %	50 %	25 %	0 %	59710609
65	NC_006840	ATT	2	6	2186	2191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006840	A	6	6	2233	2238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006840	GCC	2	6	2250	2255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_006840	T	6	6	2299	2304	0 %	100 %	0 %	0 %	59710610
69	NC_006840	AAG	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
70	NC_006840	TCT	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
71	NC_006840	TGT	2	6	2458	2463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710610
72	NC_006840	TCT	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
73	NC_006840	TAA	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710610
74	NC_006840	GTA	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710610
75	NC_006840	CCAA	2	8	2551	2558	50 %	0 %	0 %	50 %	59710610
76	NC_006840	GAA	3	9	2628	2636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
77	NC_006840	ACC	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
78	NC_006840	TCTT	2	8	2669	2676	0 %	75 %	0 %	25 %	59710610
79	NC_006840	CAT	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710610
80	NC_006840	CAC	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
81	NC_006840	GTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710610
82	NC_006840	AACC	2	8	2915	2922	50 %	0 %	0 %	50 %	59710610
83	NC_006840	AGC	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710610
84	NC_006840	TTTC	2	8	2964	2971	0 %	75 %	0 %	25 %	59710610
85	NC_006840	CTT	2	6	3012	3017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
86	NC_006840	CTG	2	6	3021	3026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
87	NC_006840	CAT	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710610
88	NC_006840	AGT	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710610
89	NC_006840	GATA	2	8	3178	3185	50 %	25 %	25 %	0 %	59710610
90	NC_006840	GTC	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
91	NC_006840	T	6	6	3217	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	59710610
92	NC_006840	TCT	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710610
93	NC_006840	CAC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
94	NC_006840	CAT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710610
95	NC_006840	T	6	6	3486	3491	0 %	100 %	0 %	0 %	59710610
96	NC_006840	TG	3	6	3567	3572	0 %	50 %	50 %	0 %	59710610
97	NC_006840	CGT	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
98	NC_006840	AAG	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
99	NC_006840	CGT	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
100	NC_006840	TTA	2	6	3629	3634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710610
101	NC_006840	ATG	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710610
102	NC_006840	CAC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710610
103	NC_006840	TTGTGA	2	12	3693	3704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710610
104	NC_006840	GAA	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710610
105	NC_006840	GTTTGT	2	12	3779	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710610
106	NC_006840	TGC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710610
107	NC_006840	TTG	2	6	3841	3846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710610
108	NC_006840	A	6	6	3854	3859	100 %	0 %	0 %	0 %	59710610
109	NC_006840	TGC	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006840	TGGG	2	8	3935	3942	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006840	CAT	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006840	TGA	2	6	4097	4102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006840	TTG	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710611
114	NC_006840	ACGA	2	8	4280	4287	50 %	0 %	25 %	25 %	59710611
115	NC_006840	TTG	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710611
116	NC_006840	CAG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710611
117	NC_006840	CTT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710611
118	NC_006840	AG	3	6	4365	4370	50 %	0 %	50 %	0 %	59710611
119	NC_006840	GCTT	2	8	4416	4423	0 %	50 %	25 %	25 %	59710611
120	NC_006840	GA	3	6	4468	4473	50 %	0 %	50 %	0 %	59710611
121	NC_006840	TCA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710611
122	NC_006840	AAT	2	6	4490	4495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006840	TAGA	2	8	4507	4514	50 %	25 %	25 %	0 %	59710612
124	NC_006840	ACG	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710612
125	NC_006840	TTACG	2	10	4546	4555	20 %	40 %	20 %	20 %	59710612
126	NC_006840	TAG	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710612
127	NC_006840	TTA	2	6	4647	4652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006840	AGT	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006840	TTAA	2	8	4673	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006840	CAA	2	6	4713	4718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006840	CAA	2	6	4754	4759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006840	CGA	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710613
133	NC_006840	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	59710613
134	NC_006840	TCA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710613
135	NC_006840	AAT	2	6	5072	5077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710613
136	NC_006840	AGT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710613
137	NC_006840	GTT	3	9	5121	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710613
138	NC_006840	AGC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710613
139	NC_006840	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710613
140	NC_006840	T	7	7	5203	5209	0 %	100 %	0 %	0 %	59710613
141	NC_006840	CGT	2	6	5214	5219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710613
142	NC_006840	TTA	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710613
143	NC_006840	TTC	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710613
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145	NC_006840	TC	3	6	5475	5480	0 %	50 %	0 %	50 %	59710613
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150	NC_006840	AG	3	6	5734	5739	50 %	0 %	50 %	0 %	59710614
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164	NC_006840	TGA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_006840	TAT	2	6	7117	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_006840	GAT	2	6	7137	7142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_006840	TAA	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_006840	T	6	6	7213	7218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_006840	TTG	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_006840	ACC	2	6	11487	11492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710619
272	NC_006840	GAA	2	6	11570	11575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710619
273	NC_006840	GTA	2	6	11588	11593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710619
274	NC_006840	TCTT	2	8	11633	11640	0 %	75 %	0 %	25 %	59710619
275	NC_006840	TATC	2	8	11652	11659	25 %	50 %	0 %	25 %	59710619
276	NC_006840	GAA	2	6	11678	11683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710619
277	NC_006840	GGT	2	6	11711	11716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710619
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279	NC_006840	TAA	2	6	11746	11751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710619
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281	NC_006840	AAC	2	6	11867	11872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710619
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284	NC_006840	AAG	2	6	11952	11957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710619
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289	NC_006840	TCT	2	6	12080	12085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710619
290	NC_006840	GCTCGT	2	12	12191	12202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710619
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293	NC_006840	TCT	2	6	12443	12448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710619
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394	NC_006840	AAG	2	6	16915	16920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710622
395	NC_006840	GAG	2	6	16924	16929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59710622
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398	NC_006840	CCA	2	6	16980	16985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59710623
399	NC_006840	AGC	2	6	17042	17047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710623
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401	NC_006840	AGT	2	6	17138	17143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710623
402	NC_006840	CTG	2	6	17158	17163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710623
403	NC_006840	CTG	2	6	17167	17172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710623
404	NC_006840	CAA	2	6	17194	17199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710623
405	NC_006840	AGA	2	6	17291	17296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710623
406	NC_006840	TTG	3	9	17323	17331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710623
407	NC_006840	GCA	2	6	17337	17342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59710623
408	NC_006840	ATTCA	2	10	17397	17406	40 %	40 %	0 %	20 %	59710623
409	NC_006840	GATT	2	8	17528	17535	25 %	50 %	25 %	0 %	59710623
410	NC_006840	CTG	2	6	17536	17541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710623
411	NC_006840	AGA	2	6	17561	17566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710623
412	NC_006840	ATC	2	6	17607	17612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710623
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414	NC_006840	AGA	2	6	17678	17683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710623
415	NC_006840	TGT	2	6	17708	17713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710623
416	NC_006840	GAA	2	6	17730	17735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710623
417	NC_006840	A	6	6	17817	17822	100 %	0 %	0 %	0 %	59710623
418	NC_006840	TTC	2	6	17928	17933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710623
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422	NC_006840	TGA	2	6	18254	18259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710623
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427	NC_006840	TTG	2	6	18439	18444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710623
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432	NC_006840	AAG	2	6	18751	18756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710623
433	NC_006840	AAG	2	6	18835	18840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710623
434	NC_006840	GTC	2	6	18847	18852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710623
435	NC_006840	TTC	2	6	18882	18887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710623
436	NC_006840	TGA	2	6	18908	18913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710623
437	NC_006840	TCT	2	6	18989	18994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710623
438	NC_006840	T	7	7	19047	19053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_006840	TAA	2	6	19086	19091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_006840	TTA	2	6	19124	19129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_006840	TTA	2	6	19189	19194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710624
443	NC_006840	TTC	2	6	19227	19232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59710624
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452	NC_006840	ATT	2	6	19643	19648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710624
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459	NC_006840	GGT	2	6	20199	20204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59710624
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470	NC_006840	T	6	6	20933	20938	0 %	100 %	0 %	0 %	59710625
471	NC_006840	CTAT	2	8	20963	20970	25 %	50 %	0 %	25 %	59710625
472	NC_006840	TTA	2	6	20994	20999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710625
473	NC_006840	TACT	2	8	21007	21014	25 %	50 %	0 %	25 %	59710625
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475	NC_006840	ACA	2	6	21051	21056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710625
476	NC_006840	T	6	6	21209	21214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_006840	TAT	2	6	21220	21225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710626
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483	NC_006840	A	8	8	21520	21527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_006840	AAC	2	6	21576	21581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_006840	TTG	2	6	21604	21609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
486	NC_006840	TATT	2	8	21685	21692	25 %	75 %	0 %	0 %	59710627
487	NC_006840	TTA	2	6	21762	21767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710627
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490	NC_006840	A	6	6	21860	21865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_006840	T	6	6	21889	21894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_006840	CAT	2	6	21895	21900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_006840	TGAA	2	8	21921	21928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_006840	T	8	8	21937	21944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_006840	TAG	2	6	21983	21988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_006840	AGTC	2	8	22102	22109	25 %	25 %	25 %	25 %	59710628
500	NC_006840	TTA	2	6	22144	22149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710628

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